Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PCK2Q16822 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms