Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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