Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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