Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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