Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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