Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms