Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SIX1Q15475 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SIX1Q15475 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SIX1Q15475 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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SIX1Q15475 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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