Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms