Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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UBE3CQ15386 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3CQ15386 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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