Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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