Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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