Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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