Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PMS2P3Q13401 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PMS2P3Q13401 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PMS2P3Q13401 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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