Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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