Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms