Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPS1Q13098 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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