Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOS1Q07889 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms