Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME1Q06323 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms