Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP27A1Q02318 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms