Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms