Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF5P84085 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF5P84085 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARF5P84085 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARF5P84085 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms