Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCS1P62166 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCS1P62166 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms