Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMPHP49418 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMPHP49418 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMPHP49418 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AMPHP49418 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms