Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCT3P49368 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCT3P49368 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCT3P49368 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCT3P49368 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCT3P49368 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCT3P49368 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCT3P49368 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCT3P49368 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms