Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP1P30622 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP1P30622 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms