Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2E2P29084 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms