Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms