Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VAMP1P23763 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms