Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms