Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEFHP12036 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms