Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2AP11388 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms