Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBP07199 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBP07199 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms