Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms