Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSD2O96028 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD2O96028 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD2O96028 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD2O96028 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSD2O96028 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms