Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1AO95602 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1AO95602 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms