Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms