Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 216.85■□□□□ 0.295e-13■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-8■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.725e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-220ENST00000524062 2285 ntTSL 217.51■□□□□ 0.395e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.065e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-204ENST00000434849 2369 ntTSL 214.61□□□□□ -0.075e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.445e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.825e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.225e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.275e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.465e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.725e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TCEA2-213ENST00000475792 655 ntTSL 216.53■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 MTSS1L-203ENST00000576338 518 ntTSL 316.78■□□□□ 0.286e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.695e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.615e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.315e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.945e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.385e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.275e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.335e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 CYP27A1-204ENST00000466602 1210 ntTSL 221.86■■□□□ 1.095e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 CYP27A1-203ENST00000445971 903 ntTSL 516.79■□□□□ 0.285e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TECPR1-217ENST00000490842 3488 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.025e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.125e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 CYP27A1-202ENST00000411688 799 ntTSL 310.37□□□□□ -0.755e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 319.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 419.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 519.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 419.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 419.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 219.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 419.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 419.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 419.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 519.83■□□□□ 0.772e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 418.52■□□□□ 0.562e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APLP2-211ENST00000529235 537 ntTSL 414.04□□□□□ -0.162e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 BCL6-203ENST00000419510 4178 ntTSL 29.26□□□□□ -0.934e-17■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 216.21■□□□□ 0.188e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GTPBP2-206ENST00000452781 681 ntTSL 519.19■□□□□ 0.663e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 LAMB2-211ENST00000483321 408 ntTSL 310.79□□□□□ -0.683e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 PCNX3-205ENST00000531280 472 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-8■■□□□ 11.4
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PRPF4O43172 PCNX3-202ENST00000439247 3104 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.121e-8■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.558e-12■■□□□ 11.4
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PRPF4O43172 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.055e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 214.83□□□□□ -0.045e-9■■□□□ 11.4
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PRPF4O43172 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.427e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.047e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 MST1-203ENST00000468847 406 ntTSL 214.09□□□□□ -0.159e-11■■□□□ 11.4
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PRPF4O43172 C7orf49-207ENST00000477820 531 ntTSL 311.19□□□□□ -0.627e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 C7orf49-204ENST00000459937 2576 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.057e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 35.51□□□□□ -1.537e-10■■□□□ 11.4
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PRPF4O43172 PKD1P6-204ENST00000540075 656 ntTSL 214.69□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-206ENST00000476579 583 ntTSL 413.68□□□□□ -0.222e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-205ENST00000473549 579 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-207ENST00000484830 527 ntTSL 412.97□□□□□ -0.332e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-208ENST00000489186 579 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-209ENST00000529194 611 ntTSL 39.28□□□□□ -0.922e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 APOL2-204ENST00000454728 577 ntTSL 48.63□□□□□ -1.032e-11■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 POLR3E-217ENST00000569757 662 ntTSL 415.88■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 FAM214A-208ENST00000562351 2993 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.615e-9■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 RAB17-209ENST00000466244 937 ntTSL 214.3□□□□□ -0.122e-8■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 217.24■□□□□ 0.357e-8■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 516.36■□□□□ 0.217e-8■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-214ENST00000591043 1764 ntTSL 521.11■□□□□ 0.971e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-202ENST00000421816 1109 ntTSL 218.36■□□□□ 0.531e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■□□□ 11.4
PRPF4O43172 GCDH-212ENST00000590530 1871 ntTSL 217.13■□□□□ 0.331e-7■■□□□ 11.4
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