Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BNH8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BNH8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BNH8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms