Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms