Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP1Q9Y3L3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP1Q9Y3L3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP1Q9Y3L3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP1Q9Y3L3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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