Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms