Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms