Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms