Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJB4Q9UDY4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJB4Q9UDY4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms