Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms