Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms