Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms