Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
KRT84Q9NSB2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT84Q9NSB2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms