Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NECTIN3Q9NQS3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms