Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms